ПробоподготовкаЭтап пробоподготовки образца отличается в зависимости от вида биоматериала:
a) При работе с осадком сперматозоидов:
Пробоподготовка не требуется, перейти к этапу лизиса.
b) При работе с образцами семенной жидкости:
Внести в пробирки объемом 1,5-2 мл 30-300 мкл образца. Центрифугировать пробирки в течение 5 минут при 13 тыс. об/мин, аккуратно, не задевая осадок, полностью удалить супернатант.
c) При работе с образцами семенной жидкости, контаминированными чужеродными клетками (эпителий влагалища, буккальный эпителий и др.):
1) В пробирки объемом 1,5-2 мл поместить исследуемые образцы, добавить 200 мкл лизирующего буфера 1 и 20 мкл Протеиназы К. Интенсивно перемешать образцы на вортексе, сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования. Инкубировать образцы при 60°C в течение 15 минут, перемешивая каждые 3-5 минут. Затем центрифугировать образцы в течение 5 минут при 13 тыс. об/мин, аккуратно, не задевая осадок, полностью удалить супернатант.
2) Повторить пункт 1.
3) Добавить к полученным осадкам 400 мкл лизирующего буфера 1. Интенсивно перемешать образцы на вортексе. Центрифугировать пробирки в течение 5 минут при 13 тыс. об/мин, аккуратно, не задевая осадок, полностью удалить супернатант.
Лизис1. К осадкам сперматозоидов добавить 400 мкл лизирующего буфера 2, 20 мкл Протеиназы К и 2 мкл стабилизатора. Вортексировать образцы до полного разрушения конгломерата клеток, сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
2. Инкубировать образцы в термостате при 60°C в течение 1-2 часов, периодически перемешивая.
3. Добавить к образцам 300 мкл связывающего буфера. Интенсивно перемешать пробирки на вортексе.
4. Центрифугировать образцы в течение 3 минут при макс. об/мин. Аккуратно, не задевая осадок, перенести максимальный объём супернатанта в новые пробирки объёмом 1,5-2 мл.
Сорбция НК1. Добавить в пробирки 300 мкл связывающего буфера и 100 мкл магнитных частиц.
2. Интенсивно перемешать пробирки на вортексе, сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
3. Инкубировать образцы при комнатной температуре в течение 5 минут, периодически перемешивая.
4. Сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
5. Инкубировать образцы на магнитном штативе в течение 3 минут. Аккуратно, не задевая магнитные частицы, удалить супернатант.
Промывка НК1. Добавить 600 мкл промывочного буфера 1.
2. Интенсивно перемешать пробирки на вортексе, сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
3. Инкубировать образцы на магнитном штативе в течение 2 минут, после чего аккуратно, не задевая магнитные частицы, удалить супернатант.
4. Добавить 600 мкл промывочного буфера 2.
5. Повторить пункты 2-3.
6. Добавить 600 мкл промывочного буфера 3.
7. Повторить пункты 2-3.
8. Высушить образцы с открытыми крышками в термостате при 56-60°C или при комнатной температуре до полного испарения промывочного буфера 3.
Элюция НК1. Добавить в пробирки 50 мкл элюирующего буфера.
2. Интенсивно перемешать пробирки на вортексе, сбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
3. Инкубировать образцы в термостате при 60°C в течение 10 минут, периодически перемешивая.
4. Cбросить капли с помощью кратковременного центрифугирования.
5. Инкубировать образцы на магнитном штативе в течение 3 минут.
6. Перенести элюат в новые пробирки объемом 1,5-2 мл.
Опционально: рекомендуется провести дополнительное центрифугирование элюата на максимальной скорости для удаления остаточного количества магнитных частиц.